Sở GD-ĐT chủ trì cụm thi phối hợp với các trường tổ chức in sao đề thi, coi thi, chấm thi, thông báo kết quả thi, phúc khảo, xét công nhận tốt nghiệp THPT và báo cáo kết quả thi, kết quả xét công nhận tốt nghiệp THPT về Bộ GD-ĐT theo quy định.
Cả nước có 63 cụm thi THPT quốc gia 2018. Trong đó cụm thi số 1 tại TP. Hà Nội có 10 Trường đơn tham gia phối hợp, gồm ĐH Quốc gia Hà Nội, Trường ĐH Bách khoa Hà Nội, Trường ĐH Hà Nội, Trường ĐH Công nghiệp Việt - Hung, Trường ĐH Lâm nghiệp, Trường ĐH Y Hà Nội, Học viện Y dược cổ truyền, Trường ĐH Công nghiệp dệt may Hà Nội, Trường ĐH Công nghiệp Hà Nội; Học viện Kỹ thuật quân sự.
Cụm thi số 2 tại TP.HCM có 7 đơn vị phối hợp tổ chức kỳ gồm các trường: ĐH Quốc gia TP.HCM, Trường ĐH Y dược TP.HCM, Trường ĐH Nguyễn Tất Thành, Trường ĐH Hoa Sen, Trường ĐH Quốc tế Hồng Bàng, Trường ĐH Văn Hiến và Trường ĐH Y khoa Phạm Ngọc Thạch.
Cụm thi số 28 tại tỉnh Nghệ An có 8 đơn vị phối hợp gồm: Trường ĐH Vinh, ĐH Sư phạm kỹ thuật Vinh, Trường ĐH Y khoa Vinh, Trường ĐH Công nghiệp Vinh, Trường ĐH Thăng Long, Trường ĐH Công đoàn, Học viện Hành chính quốc gia và Trường CĐ Sư phạm Nghệ An.
Nhiều cụm thi có đơn vị chủ trì và đơn vị phối hợp đều thuộc tỉnh nhà như cụm thi số 59 tại Trà Vinh do Sở GD-ĐT Trà Vinh chủ trì; đơn vị phối hợp cũng là Trường ĐH Trà Vinh; Cụm thi số 55 tại TP. Cần Thơ do Sở GD-ĐT Cần Thơ chủ trì, còn đơn vị phối hợp là Trường ĐH Cần Thơ và Trường CĐ Cần Thơ; Cụm thi 47 tại tỉnh Bình Dương do Sở GD-ĐT Bình Dương chủ trì, còn đơn vị phối hợp là Trường ĐH Thủ Dầu Một và Trường ĐH Bình Dương.
Ngoài ra cụm thi số 41 tại Đắc Nông chỉ có 2 đơn vị phối hợp tổ chức thi là Sở GD-ĐT Đắk Nông và Trường ĐH Giao thông Vận tải TP.HCM.